1943/44

     Gracias al entusiasmo de varios aficionados, con José Luis Luna Porredón como presidente, se reorganiza el Club Deportivo Manchego, para aglutinar a todos los aficionados al fútbol de Ciudad Real. Se conserva el nombre y el uniforme primitivos, adoptándose un nuevo escudo, más representativo y original que el antiguo. El Manchego queda englobado en la Tercera División, siendo el primer equipo de la provincia que disputa sus partidos en categoría nacional. Juega sus primeros encuentros en el campo del Regimiento de Artillería, hasta la conclusión de las obras de acondicionamiento del campo de la Puerta de Granada, al que se retorna el 14 de noviembre. El entrenador es Eguren y se logra el noveno puesto, consiguiéndose la permanencia en la categoría con un equipo netamente local. Se juega también la Copa del Generalísimo, quedando exento de la primera eliminatoria. En la segunda, en partido único disputado en Ciudad Real, Manchego 3 - Mediodía 2. En la siguiente, victoria del Badajoz por 3-0, en partido único disputado en tierras extremeñas.

Fotografía histórica tomada en Toledo el 26 de septiembre de 1943 y correspondiente al primer partido que disputó el Club Deportivo Manchego en categoría nacional. De pie: Prieto, Víctor, Cuadra, Marín, Coll II y Arjona. Agachados: Molina, Beberide, Coll I, Solana y Poblete.

1944/45

     Segundo año en la presidencia de José Luis Luna, y primero de Ricardo Álvarez como entrenador. El equipo logra un meritorio tercer puesto, pero sobre todo destaca la consecución de la Copa de Castilla de Aficionados, al imponerse en la final a la Ferroviaria de Madrid. Ya en la fase nacional, el Manchego eliminó al Algeciras, pero cayó eliminado en los cuartos de final ante el Almoradí. 

De pie: Mateo, Coll I, Coll II, Marín, Mena y Cuadra. Agachados: Agudo, Aguinaga, Prieto, Cea y Poblete.

1945/46

     Accede a la presidencia Ismael López de Sancho y continúa como entrenador Ricardo Álvarez. Se logra una honrosa cuarta plaza, superado por Badajoz, Cacereño y Toledo. Esta temporada juega Yayo en el Manchego, que años más tarde, y ya conocido como Sobrado, llegaría a ser internacional con la selección española. De nuevo el equipo se proclama finalista de la Copa de Castilla de Aficionados, también ante la Ferroviaria, pero en el partido de vuelta disputado en Madrid, el Manchego es víctima de una vergonzosa encerrona y cae derrotado, ante la indignación de la directiva y aficionados de Ciudad Real.

1946/47

     Tras los tristes sucesos de la final de la Copa de Castilla del año anterior, dimite toda la Junta Directiva, por lo que aparece un nuevo presidente, Victorino Rodríguez Velasco. Tampoco continúa Ricardo Álvarez en el banquillo y se hace cargo de los entrenamientos el capitán Solana. El Manchego logra la séptima plaza y se ve obligado a jugar una fase para mantener la categoría, lo que se consigue, aunque con bastantes apuros.

1947/48

     Continúa en la presidencia Victorino Rodríguez. El Manchego comienza a disputar sus encuentros en el mítico estadio de la Puerta de Santa María. Se ficha como entrenador a Antonio Rey, el cual es sustituido en la séptima jornada por Pedrín, tras perder todos los partidos disputados. El equipo logra una mediocre duodécima plaza, aunque destaca el debut en el equipo del jugador local Adolfo, que se convertirá con el paso de los años en una de las leyendas de la historia del club. En la Copa del Generalísimo, tras quedar exento de la primera ronda, en la segunda, derrota ante el Tomelloso por 4-1, con gol de Hériz, en eliminatoria a partido único disputado en Tomelloso.

Manchego que se enfrentó en Sevilla al Real Betis. De pie: Marchena, Poblete, Solana, Clavijo, Mena y Yanini. Agachados: Bedmar, Domínguez, Díaz, Heriz y Toribio.

1948/49

     Retorna a la presidencia José Luis Luna Porredón y continúa como entrenador Pedrín, el cual, tras lograr una sola victoria en ocho partidos, es sustituido por Cayuso. Sin embargo, el cambio no da los frutos esperados y la Directiva le da la carta de libertad junto a siete jugadores, tras la jornada 18 y en penúltima posición de la tabla. Se hace cargo del equipo para el resto de la campaña el periodista Kasama, quien apoyado por Esteban Núñez de Arenas, profesor de educación física, logra salvar la situación y mantener la categoría con la duodécima plaza. Destaca en esta temporada el debut de otro local, Valch, que se convertirá en el jugador que más temporadas ha defendido la elástica azul mancheguista. En la Copa del Generalísimo, de nuevo el Tomelloso, y esta vez la eliminatoria a partido único se disputa en Ciudad Real, pero vence el Tomelloso por 1-3, con gol mancheguista de Iglesias.

De pie: Montes, Curro, Costoso, Solana, Gallego, Alonso, Marín y Poblete. Agachados: Adolfo, Jovito, Sanete y Valch.

1949/50

     Con esta temporada se inicia un ciclo en que el Manchego abandona las malas posiciones de estos dos últimos años y va a estar luchando por los puestos de cabeza. Sigue como presidente José Luis Luna, y llega un entrenador que va a pasar a la historia del club, Modesto Maside. Se ficha una serie de jugadores jóvenes madrileños, que van a tener todos una gran proyección, como Rodríguez, Las Heras, Carbonell y Nino, algunos de los cuales llegarán a jugar en Primera División. Esta temporada se logra terminar en cuarta posición y se consigue ganar todos los partidos jugados en Ciudad Real, pasando a la leyenda mancheguista la delantera compuesta por Rodríguez, Nino, Las Heras, Carbonell y Jovito.

De pie: Galiana, López, Valch, Gallego, Poblete, Adolfo y Modesto Maside. Agachados: Rodríguez, Montes, Nino, Las Heras, Carbonell y Jovito.